Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem248Q3TBN1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem248Q3TBN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms