Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptcd3Q14C51 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptcd3Q14C51 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptcd3Q14C51 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms