Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gli2Q0VGT2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli2Q0VGT2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms