Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf541Q0GGX2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf541Q0GGX2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms