Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700061G19RikQ08EE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700061G19RikQ08EE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms