Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SctQ08535 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SctQ08535 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SctQ08535 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SctQ08535 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SctQ08535 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SctQ08535 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SctQ08535 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SctQ08535 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SctQ08535 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SctQ08535 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SctQ08535 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SctQ08535 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SctQ08535 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SctQ08535 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SctQ08535 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SctQ08535 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SctQ08535 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SctQ08535 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms