Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxcr5Q04683 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cxcr5Q04683 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcr5Q04683 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms