Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1sQ02789 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1sQ02789 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1sQ02789 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms