Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmgcrQ01237 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms