Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfdP97946 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfdP97946 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfdP97946 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VegfdP97946 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms