Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smyd1P97443 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd1P97443 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd1P97443 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd1P97443 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smyd1P97443 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smyd1P97443 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd1P97443 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms