Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX6P78412 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX6P78412 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX6P78412 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRX6P78412 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IRX6P78412 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
IRX6P78412 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX6P78412 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRX6P78412 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX6P78412 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRX6P78412 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRX6P78412 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX6P78412 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IRX6P78412 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IRX6P78412 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IRX6P78412 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IRX6P78412 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IRX6P78412 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX6P78412 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX6P78412 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX6P78412 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms