Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PtprvP70289 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprvP70289 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprvP70289 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprvP70289 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprvP70289 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprvP70289 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprvP70289 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms