Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DccP70211 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DccP70211 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DccP70211 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DccP70211 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DccP70211 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DccP70211 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DccP70211 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DccP70211 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DccP70211 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DccP70211 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DccP70211 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DccP70211 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DccP70211 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DccP70211 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DccP70211 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DccP70211 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DccP70211 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DccP70211 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DccP70211 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DccP70211 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DccP70211 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DccP70211 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DccP70211 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DccP70211 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DccP70211 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DccP70211 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DccP70211 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DccP70211 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DccP70211 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DccP70211 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DccP70211 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DccP70211 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DccP70211 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DccP70211 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DccP70211 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DccP70211 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DccP70211 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DccP70211 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DccP70211 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms