Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrig1P70193 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrig1P70193 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms