Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo1P63166 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo1P63166 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo1P63166 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo1P63166 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo1P63166 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo1P63166 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms