Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps5P59438 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps5P59438 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps5P59438 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms