Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Senp1P59110 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp1P59110 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Senp1P59110 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Senp1P59110 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Senp1P59110 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Senp1P59110 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms