Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf5P56477 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf5P56477 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf5P56477 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf5P56477 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf5P56477 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf5P56477 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms