Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GalcP54818 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GalcP54818 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GalcP54818 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GalcP54818 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GalcP54818 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GalcP54818 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GalcP54818 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GalcP54818 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GalcP54818 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GalcP54818 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GalcP54818 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GalcP54818 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GalcP54818 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GalcP54818 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GalcP54818 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GalcP54818 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GalcP54818 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GalcP54818 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GalcP54818 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GalcP54818 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GalcP54818 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GalcP54818 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GalcP54818 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GalcP54818 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GalcP54818 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GalcP54818 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GalcP54818 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms