Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbp3P49194 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms