Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmc2P46471 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms