Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HttP42859 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HttP42859 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HttP42859 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HttP42859 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HttP42859 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HttP42859 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HttP42859 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HttP42859 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HttP42859 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HttP42859 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HttP42859 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HttP42859 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HttP42859 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HttP42859 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HttP42859 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HttP42859 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HttP42859 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HttP42859 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HttP42859 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HttP42859 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HttP42859 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HttP42859 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HttP42859 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HttP42859 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HttP42859 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HttP42859 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HttP42859 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HttP42859 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HttP42859 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HttP42859 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HttP42859 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms