Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csf3rP40223 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csf3rP40223 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms