Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddit3P35639 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms