Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Pola1P33609 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pola1P33609 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pola1P33609 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pola1P33609 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms