Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc1P29341 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms