Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif5cP28738 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kif5cP28738 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms