Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Twist1P26687 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms