Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms