Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gabra6P16305 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra6P16305 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms