Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkceP16054 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkceP16054 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkceP16054 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkceP16054 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms