Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp53P15975 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp53P15975 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms