Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme1P15532 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme1P15532 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme1P15532 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme1P15532 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms