Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Surf1P09925 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Surf1P09925 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Surf1P09925 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms