Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TnfP06804 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TnfP06804 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TnfP06804 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TnfP06804 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TnfP06804 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TnfP06804 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TnfP06804 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TnfP06804 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms