Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ItgamP05555 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ItgamP05555 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgamP05555 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms