Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01741 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01741 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01741 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01741 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01741 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01741 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01741 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01741 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01741 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01741 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01741 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms