Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01727 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01727 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01727 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01727 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01727 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01727 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01727 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01727 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01727 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01727 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01727 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01727 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01727 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01727 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01727 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01727 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01727 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms