Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme6O88425 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme6O88425 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme6O88425 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme6O88425 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme6O88425 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms