Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk1O70551 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srpk1O70551 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms