Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xirp1O70373 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xirp1O70373 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xirp1O70373 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xirp1O70373 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xirp1O70373 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Xirp1O70373 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xirp1O70373 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms