Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DffaO54786 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DffaO54786 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DffaO54786 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DffaO54786 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DffaO54786 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DffaO54786 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DffaO54786 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DffaO54786 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DffaO54786 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DffaO54786 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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