Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin1O54724 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin1O54724 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms