Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klrk1O54709 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klrk1O54709 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klrk1O54709 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms