Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpibO35906 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpibO35906 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SpibO35906 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpibO35906 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpibO35906 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpibO35906 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SpibO35906 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SpibO35906 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SpibO35906 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SpibO35906 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SpibO35906 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SpibO35906 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpibO35906 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpibO35906 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SpibO35906 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpibO35906 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpibO35906 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpibO35906 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpibO35906 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpibO35906 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpibO35906 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpibO35906 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpibO35906 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpibO35906 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpibO35906 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpibO35906 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpibO35906 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpibO35906 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms