Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kif3cO35066 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kif3cO35066 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3cO35066 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms