Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sypl1O09117 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sypl1O09117 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sypl1O09117 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms