Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A3

Gm2244, Predicted gene 2244, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2244L7N2A3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2244L7N2A3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm2244L7N2A3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2244L7N2A3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm2244L7N2A3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm2244L7N2A3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms