Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim18J3QNP2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim18J3QNP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim18J3QNP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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